--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/MPIWGRoot_deleted_methods.py	Wed Jan 30 11:47:21 2013 +0100
@@ -0,0 +1,184 @@
+       def removeStopWords(self,xo):
+        """remove stop words from xo"""
+        if not hasattr(self,'_v_stopWords'):
+            self._v_stopWords=self.stopwords_en.data.split("\n")
+    
+        x=str(xo)
+    
+        strx=x.split(" ")
+  
+        for tmp in strx:
+     
+            if tmp.lower() in self._v_stopWords:
+                del strx[strx.index(tmp)]
+
+        return " ".join(strx)
+    
+    
+    def getGetNeighbourhood(self,obj, wordStr, length=100,tagging=True):
+        """finde umgebung um die worte in wordStr, zurueckgegeben wird eine Array mit den Umgebungen von Fundstellen der Worte
+        alle Tags werden entfernt, die Fundstellen werden mit <span class="found">XX</span> getaggt, die Umgebungen werden 
+        case insensitive gesucht
+        @param wordStr: string mit Worten getrennt durch Leerzeichen, Phrasen sind mit " gekennzeichnet
+                        "eine phrase", "*"  bezeichnet wildcards und wird ignoriert"
+        @param length: optional, default wert 100, 2*length ist die groesse der Umgebung
+        @param tagging: optional default wert true, kein span tag wird erzweugt falls tag=false
+        """
+        
+        ret=[] # nimmt das Array auf, dass spaeter zurueckgegeben wird
+        ranges=[] #Array mit tupeln x,y wobei x die Position des Anfang und y des Endes der i-ten Umgebung angiebt
+        
+        wordStr=wordStr.lstrip().rstrip()
+        
+        def isInRanges(nr,length):
+            """test ob eine gegeben Position nr schon irgendwo in einer Umgebung ist, gibt den Index des ersten Wertes aus ranges zurueck, 
+            -1, wenn kein Treffer
+            
+            @param nr: Position die geprueft werden soll
+            @param length: Laenge des Wortes das geprueft werden soll
+            """
+            for x in ranges:
+                if (x[0]<=nr) and (nr < (x[1]-length)):
+                    return ranges.index(x)
+            return -1
+                
+        # deal with phrases, in Phrasen werden die Leerzeichen durch "_" ersetzt.
+        def rep_empty(str):
+            x= re.sub(" ","_",str.group(0))
+            return re.sub("\"","",x)
+            
+        wordStr=re.sub("\".*?\"", rep_empty,wordStr)#ersetze leerzeichen in " " durch "_" und loesche "
+        
+        #deal with wildcards, for our purposes it is enough to delete the wildcard 
+        wordStr=wordStr.replace("*","")
+        
+        words=wordStr.split(" ")
+        #if not words is ListType:
+        #   words=[words]
+        
+        
+        txtCache = self.en.getHarvestCache();
+        txt=  txtCache.get(obj.absolute_url(),None)
+       
+        if txt==None:
+            
+            logging.debug("NO CACHE for: "+obj.absolute_url())
+            txt=obj.harvest_page(mode="slim")
+        
+        
+        if not txt:
+            return ret
+        
+        soup = BeautifulSoup(txt)
+        
+        comments = soup.findAll(text=lambda text:isinstance(text, Comment))
+        [comment.extract() for comment in comments]
+        
+        txt = ''.join(soup.findAll(text=True))
+        
+        
+        #txt=re.sub("<.*?>", "", txt) # loesche alle Tags
+        for word in words:
+            word=re.sub("_"," ",word) # ersetze zurueck "_" durch " "
+            pos=0
+            
+            n=txt.lower().count(word.lower()) # wie oft tritt das Wort auf
+
+            for i in range(n):
+                pos=txt.lower().find(word.lower(),pos)
+
+                if pos > 0:
+                    x=max(0,pos-length)
+                    y=min(len(txt),pos+length)
+                  
+                    
+                    #is word already in one of the results
+                    nr=isInRanges(pos,len(word))
+                    if nr >=0:# word ist in einer schon gefunden Umgebung, dann vergroessere diese
+                        x=min(ranges[nr][0],x)
+                        y=max(ranges[nr][1],y)
+              
+                    str=txt[x:y]
+                    if x!=0: #add dots if in the middle of text
+                        str="..."+str
+                    
+                    if y!=len(txt): #add dots if in the middle of text
+                        str=str+"..."
+                        
+                        
+                
+                    if nr >=0: # word ist in einer schon gefunden Umgebung
+                        ranges[nr]=(x,y) # neue Position der Umgebung
+
+                        ret[nr]=str # neue Umgebung
+                    else: # andernfalls neue Umgebung hinzufuegen
+                        ranges.append((x,y))
+
+                        ret.append(str)
+                    
+                    pos=pos+len(word)
+                else:
+                    break;
+                
+        # now highlight everything        
+        if tagging:
+            for x in range(len(ret)):
+                for word in words:
+                    repl=re.compile(word,re.IGNORECASE)
+                    ret[x]=repl.sub(""" <span class="found">%s</span>"""%word.upper(),ret[x])
+
+        return ret
+    def copyAllImagesToMargin(self):
+        """tranformiere alle Bilder in die Margins"""
+        projects=self.getTree()
+        ret=""
+        for project in projects:
+            proj=project[3]
+            try:
+                persons=proj.copyImageToMargin();
+            except:
+                logging.error("Cannnot do: %s"%repr(project))
+                
+    def transformProjectsToId(self):
+        """trnasformiere zu ID, Hilfsfunktion die die alten Templates analysiert und mit der neuen Liste
+        verantwortlicher Personen versieht"""
+        projects=self.getTree()
+        ret=""
+        for project in projects:
+            
+            proj=project[3]
+            persons=proj.identifyNames(proj.getContent('xdata_01'))
+            if not hasattr(proj,'responsibleScientistsList'):
+                        proj.responsibleScientistsList=[]
+                        
+            for person in persons.items():
+              
+                if len(person[1]) >1: #nicht eindeutig
+                    ret+="nicht eindeutig ---  %s:  %s\n"%(proj.getId(),person[0])
+                    
+                elif len(person[1]) ==0: #kein eintrage
+                    ret+="kein eintrag---  %s:  %s\n"%(proj.getId(),person[0])
+                    proj.responsibleScientistsList.append((person[0],""))
+                else:           
+                    proj.responsibleScientistsList.append((person[0],person[1][0].getObject().getKey()))
+        
+        return ret
+          
+                
+    def harvestProjects(self):
+        """harvest"""
+        folder="/tmp"
+        try:
+            os.mkdir("/tmp/harvest_MPIWG")
+        except:
+            pass
+        founds=self.ZopeFind(self.aq_parent.projects,obj_metatypes=['MPIWGProject'],search_sub=1)
+        for found in founds:
+            txt=found[1].harvest_page()
+        
+            if txt and (txt != ""):
+                name=found[0].replace("/","_")
+                fh=file("/tmp/harvest_MPIWG/"+name,"w")
+                fh.write(txt)
+                fh.close()
+                
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